Ա. Ալիխանյանի անվան ազգային գիտական լաբորատորիայի վարչակազմն ապահովում է ԱԱԳԼ-ի վարչական, ֆինանսատնտեսական, կազմակերպական և օժանդակ աշխատանքների արդյունավետ իրականացումը։ Վարչական ստորաբաժանումները համակարգում են հիմնադրամի ընթացիկ գործունեությունը, աջակցում գիտավարչական և վարչատնտեսական գործընթացների կազմակերպմանը, ինչպես նաև ստեղծում հիմնադրամի բնականոն և արդյունավետ աշխատանքի համար անհրաժեշտ պայմաններ։