Ա. Ալիխանյանի անվան ազգային գիտական լաբորատորիայի վարչակազմը ապահովում է լաբորատորիայի վարչական, ֆինանսատնտեսական, կազմակերպական և օժանդակ գործընթացների արդյունավետ իրականացումը։ Վարչակազմի ստորաբաժանումները համակարգում են լաբորատորիայի առօրյա գործունեության կազմակերպումը, աջակցում գիտական և կառավարչական գործընթացներին, ինչպես նաև ապահովում անհրաժեշտ պայմաններ լաբորատորիայի բնականոն աշխատանքի համար։